菌肥的市场是一个百花齐放的市场，同时也是一个鱼龙混杂的市场，推广菌肥的企业都说有其他企业没有的牛逼菌种，对于大多数零售商朋友来说分辨菌肥的能力绝对没有分辨农药的能力强（毕竟农药行业比较规范了）。土壤中有益的微生物就那几种，所有菌肥也就细菌类（各种芽孢杆菌、光合菌）、真菌类（菌根真菌）和放线菌类（抗生素类），目前市场上规范化企业的流通产品基本上就这几种。

土壤微生物是土壤中细菌[细菌（学名：Bacteria）是生物的主要类群之一，属于细菌域。]、真菌[真菌，是一种真核生物。]、放线菌[放线菌，是一类主要呈菌丝状生长和以孢子繁殖的陆生性较强大的原核生物。]和藻类的总称。土壤中一般以细菌数量最多，占总数的70%-90%，有益的细菌有固氮菌、硝化细菌[硝化细菌(Nitrifyingbacteria)是一类好氧性细菌，包括**酸菌和硝酸菌。]和腐生细菌，有害的则有反硝化细菌。放线菌也属于细菌（原核生物，但有与真菌类似的菌丝和孢子），土壤中的数量仅次于细菌，放线菌能够分解动植物的残体，由蛋白质分解氨，使土壤中的有机质增加，提高土壤肥力，但对其他微生物生长

微生物肥料是活体肥料，它的作用主要靠它含有大量的有益微生物活体生命活动来完成。只有当这些有益微生物进入旺盛的繁殖和新陈代谢情况下，物质转换和代谢产物才能不断形成，因此微生物肥料中有微生物的种类，生命活动是否旺盛是具有效性的基础，而不像其他肥料适于氮、磷、钾主要元素形式和含量多少为基础。正因为微生物非常是活制剂，所以其肥效与活菌数量、强度及周围环境条件密切相关，包括温度，水分，酸碱度，营养条件及原生物的在土壤中的排斥作用都有一定影响，因此在应用时要加以注意。微生物还有一些其他肥料没有的特殊作用，能提高化肥利用率，环保绿色食品生产，随着化肥大量使用和利用率不断降低，也是众所周知的事实。微生物肥料在

长期以来农业上对微生物肥料的看法存在一些误解和偏见。一种看法认为它肥效很高，把它当成万能肥料，甚至扬言可以完全取代化肥。另一种看法是认为他根本不是肥料。其实这两种都是偏见，国内外多年试验证明，用根瘤菌剂接种大豆、花生等豆科植物可提高共生固氮效能，确实有增产效果。合理应用其它菌肥拌种或使用微生物肥料对非豆科植物也有增产效果，而且有化肥达不到的效果。因此我们认为他是肥料，又有传统化肥或有机肥在概念和内涵上不同。那么怎样正确使用微生物肥料呢？微生物肥料适合穴施、撒施，与有机肥料混合使用。单独使用效果不好，叶面喷雾更是没有作用。因此农民在使用上尽量与农家有机肥混合使用。适合做追肥、基肥、种肥、底肥使用

生物肥就是以微生物的生命活动导致作物得到特定肥料效应的一种制品，是农业生产中使用肥料的一种。在我国已经有近50年的使用历史，从根瘤菌，到细菌肥料，再到微生物肥料，见证了我国微生物肥料逐步发展演变过程。说通俗点，微生物是低级生命存在，是细菌(有益菌)，如果用杀菌剂、杀虫剂混合或者使用微生物肥之后，再使用杀菌剂，会大大降低微生物肥的肥效和使用效果。自然界中，有不少微生物(病毒，细菌，真菌等。具有杀虫、杀菌、除草、调节植物生长活性，这种微生物具有很高的专一性，其对靶标还有最有极高的选择性，对其他生物却十分安全。